PLUMED jest wtyczką działającą z wieloma programami do dynamiki molekularnej (w CI TASK został skompilowany z programem Gromacs). Dostarcza narzędzi do analizy dużej ilości danych generowanych przez symulacje dynamiki molekularne, metod do obliczania energii swobodnej układów molekularnych oraz algorytmów typu enhanced sampling.
PLUMED w CI TASK
- Aktualnie zainstalowana wersja: PLUMED 2.6.2, Gromacs 2020.4 + PLUMED 2.6.2
- Pakiet jest zainstalowany na komputerze: Tryton Plus
- Status licencji: open source license
- Strona producenta oraz dokumentacja: The community-developed PLUgin for MolEcular Dynamics
Uwagi dotyczące uruchamiania pakietu:
- patrz: moduły