NAMD – Scalable Molecular Dynamics – pakiet służący do symulacji metodą dynamiki molekularnej, z wykorzystaniem pola siłowego Charm++ . Pozwala na analizę dużych i bardzo dużych układów biologicznych (białka, kwasy nukleinowe).
NAMD w CI TASK
- Najnowsza zainstalowana wersja: 2.14
- Miejsce instalacji: Tryton
- Dokumentacja: NAMD User's Guide (strona producenta)
- Status licencji: akademicka, darmowa (wymagana jest rejestracja)
- Strona producenta: Theoretical and Computational Biophysics Group
Uwagi dotyczące uruchamiania pakietu: