Sambamba

Sambamba to narzędzie do pracy z formatami SAM (Sequence Alignment/Map), BAM (binarny SAM), CRAM (alternatywa dla SAM/BAM).

Patrz: GATK, Picard, Platypus

Sambamba w CI TASK

  • Aktualnie zainstalowana wersja: 0.7.0
  • Miejsce instalacji: Tryton
  • Status licencji: GPL v2+
  • Dokumentacja: Sambamba Documentation
  • Więcej informacji: Artem Tarasov, Albert J. Vilella, Edwin Cuppen, Isaac J. Nijman, Pjotr Prins, "Sambamba: fast processing of NGS alignment formats", Bioinformatics, Volume 31, Issue 12, 15 June 2015, Pages 2032–2034, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv098

Uwagi dotyczące uruchamiania pakietu: